Soll im Anschluss an die Elementgehalt-Messung auch die Messung zur Bestimmung der Isotopenzusammensetzung folgen, ist es nötig die Proben noch weiter vorzubereiten. In der Sr/Matrix TRENNUNG werden bestimmte Elemente vom Strontium abgetrennt. Besonders wichtig ist es, das Rubidum 87 abzutrennen, wenn später das Strontiumverhältnis der Isotope ⁸⁷Sr und ^86Sr bestimmt werden soll. Denn beim Messen des Strontium 87 würde das Rubidium 87 aufgrund der gleichen Masse (87) das Messergebnis verfälschen. Die Separation ist durch ein spezielles HARZ („RESIN“) möglich, dass aufgrund seiner Molekülstruktur nur das Strontium „gefangen“ hält. Alle anderen Elementatome und Elementmoleküle können das Harz passieren.
Erfolgt am Ende eine PH-Wert Änderung, geht das Strontium wieder in Lösung, das Harz lässt es also wieder „los“. Die Lösung mit dem Strontium wird in Eprouvetten aufgefangen. In dieser Lösung können die Strontiumisotope ohne Interferrenz gemessen werden.